Bij activering van het immuunsysteem in één van de CMIS onderdelen (bijvoorbeeld door een bacterie) worden de andere onderdelen geïnformeerd om antilichamen tegen deze indringer te vormen in alle structuren van het CMIS.
Juist deze communicatie tussen de verschillende onderdelen van het CMIS geeft een verklaring voor het optreden van aandoeningen aan het bewegingsapparaat door bijvoorbeeld een luchtweginfectie, maar ook door een darmontsteking. Bij slijmvliesklachten aan één van de onderdelen van het CMIS wordt dan ook altijd de darm mee behandeld. Bij een verhoogd doorlaatbare darmwand door toxinestapeling kunnen allerlei stoffen in het lichaam komen die er niet thuis horen en dus ook weer in alle onderdelen klachten kunnen geven. Bij een reeds langer bestaande disbalans van de darm, kunnen op den duur alle onderdelen van het CMIS klachten geven.
Het feit dat de cellen van het CMIS opvallend gevoelig zijn voor stress, geeft een verklaring voor het ontstaan van aandoeningen aan, bijvoorbeeld het bewegingsapparaat, door chronische of acute emotionele en/of psychische trauma’s.
Mede daarom is voeding en onthaasten zo enorm belangrijk